新《商標法》規(guī)定了商標侵權糾紛自行協(xié)商解決的程序，其目的：
一是鑒于有些侵權行為僅僅侵犯了注冊人的利益，并未給他人帶來損害，注冊人自行協(xié)商，可化解因此產(chǎn)生的爭議。
二是可適當減少商標糾紛當事人為解決糾紛所投入的精力。
三是當事人通過協(xié)商減少商標案件數(shù)量，使執(zhí)法部門更有效地利用好現(xiàn)有的執(zhí)法資源。但應當注意，自行協(xié)商的商標侵權糾紛首先是未構成刑事犯罪行為的糾紛，對以假冒他人注冊商標為主業(yè)且數(shù)額達到犯罪立案標準的行為人，必須追究刑事責任。
其次，自行協(xié)商解決的糾紛案件，其侵權行為一般情節(jié)比較輕微，后果不嚴重，可以免予行政處罰，即行政責任可予以免除。
第三，對侵權行為的查處主要目的是保護權利人的民事權益不受侵害，協(xié)商解決即意味著權利人自己已經(jīng)認為未對本權利造成危害或者危害后果不嚴重，從而放棄了對侵權人追究民事責任的權利。
在執(zhí)法實踐中可按如下原則掌握：
1、除商標注冊人投訴的案件外，一般情況下，工商機關查辦的商標侵權案件，不主動要求當事人進行協(xié)商。如果當事人主動要求協(xié)商，可給其一定的期限自行協(xié)商，到期未提供已經(jīng)協(xié)商解決的證據(jù)，則宜按照商標侵權案件進行行政處理。
2、工商機關接受商標權利人投訴的案件，應當視為權利人已經(jīng)放棄協(xié)商或者已經(jīng)協(xié)商不成了，立案工商部門不再主動進行當事人之間的協(xié)商和解工作。
3、就商標糾紛已經(jīng)立案的工商機關，應涉案當事人請求，在未就該案件做出行政處理決定之前，涉案當事人又經(jīng)協(xié)商同意和解的，若其和解未危害社會公共利益，工商機關可以應其書面請求做出撤案(銷案)處理。